Un comité de pilotage Natura 2000 est créé par le Préfet pour élaborer et suivre la mise en œuvre du document d'objectifs. Ce dernier comprend les collectivités territoriales intéressées et leurs groupements ainsi que les usagers du site Natura 2000. Les représentants de l'Etat y siègent à titre consultatif.
Les représentants des collectivités territoriales et de leurs groupements désignent :
- le président du comité de pilotage Natura 2000
- la collectivité territoriale ou le groupement chargé de l'élaboration du document d'objectifs (« opérateur ») et du suivi de sa mise en œuvre (« animateur »)
